La missione di Fondazione Filarete è quella di coordinare gruppi di ricerca di alto livello, strumentazioni e laboratori all’avanguardia, competenze di gestione e sostegno finanziario al fine di generare e diffondere l'innovazione.

Per potenziare le risorse intellettuali e finanziarie presenti in Lombardia, Università degli Studi Milano, Fondazione Cariplo, Intesa Sanpaolo e Camera di Commercio di Milano si sono unite per dare vita ad un centro la cui missione è creare, ospitare e favorire iniziative imprenditoriali high-tech in tutte le aree di competenza dell'Università degli Studi di Milano.

Fondazione Filarete gestisce un Acceleratore di Impresa, strategicamente posizionato nella zona sud di Milano in prossimità e stretta connessione con Università, istituzioni di ricerca pubbliche e private leader nella ricerca biotecnologica e medica.